《佛母大孔雀明王经》裏面的「陀罗尼」，占了极大的篇幅。「陀罗尼」是梵语的译音，意译为「总持」。谓持善法而不散，伏恶法而不起的力用。亦称咒语、秘密语、真言等。《法相辞典》（朱芾煌编）注：《佛地经论》五卷十五页云：「陀罗尼者，增上念慧，能总任持无量佛法，令不忘失。 于一法中，持一切法；于一文中，持一切文；于一义中，持一切义。摄藏无量诸功德故；名无尽藏。此陀罗尼，略有四种：一、法陀罗尼，二、义陀罗尼，三、咒陀罗尼，四、能得菩萨忍陀罗尼。」
佛教咒语有「五不翻」之做法：
一、秘密之，故不翻，如陀罗尼者。
二、含多义，故不翻，如薄伽梵之语具六义者。
三、此方所无，故不翻，如阎浮树者。
四、顺于古例，故不翻，如阿耨菩提者。是非不可翻，以摩腾以来常存梵音故也。
五、为生善，故不翻，如般若者。谓般若二字，闻之者生信念，以如译为智慧，则生轻浅之意故也。
所以，相对地咒语所包括的真实含义，是没有办法去了解，但是现今做咒语翻译的梵文学者，也给咒语学人提供了某种程度上的帮助。
语言是心灵的展现，咒语拥有不可言表的巨大力量。咒有善咒、恶咒之别。如为人治病或为防护己身者，即为善咒；咒诅他人令罹灾害者即为恶咒。《四分律》卷三十云︰「若学咒腹中虫病，若治宿食不消 ；若学书、学诵，若学世论为伏外道故；若学咒除毒，为自护，不以为活命，无犯。」因咒语具神效，对于修道，佛法认为咒术是无益的，也不许僧众利用咒术来获取生活（邪命）。另世俗有以咒术杀生者，现在各部广律也考虑到咒术杀害生命所犯罪过的轻重，可见戒律对持咒一事的态度。
在佛法中，起初是谛语──真诚不虚妄的誓言，是佛力、法力、僧力──三宝的威力，修行者的功德力，也能得龙天的护助。谛语与三宝威力相结合，论性质，与咒术是类似的。所以《十诵律》称说谛语为「咒愿」；《四分律》等称谛语为「护咒」。《四分律》云︰「自护慈念咒︰毗楼勒叉慈（中略）慈念诸龙王，干闥婆，罗刹婆，今我作慈心，除灭诸毒恶，从是得平复。断毒，灭毒，除毒，南无婆伽婆。」这就是慈心的谛语。
《显密圆通成佛心要集》卷下云：「真言中每 一一字，皆是诸佛全身。末法中一字咒经云：吾灭度之后变身作此咒等。」又云：「一切真言更无胜劣，皆是毗卢遮那大不思议秘密心印。一代教中乃至鬼神 所说真言，皆是毗卢遮那如来欲普门益生，全体变作 彼鬼神类而说真言；非实鬼神能说真言，余类皆尔。」是故应知：咒既是诸佛心印，咒在即佛在。
有此一说： 「有关密宗咒语与音声神秘作用，以及咒语的音声与人体的奥秘关系，的确不是片言可尽其妙。而且以上所說念诵方法的巧妙，也无法以我笨拙的文字表达它的究竟。一切均需自己潜心钻研，同时求乞名师经验的教导，以身体力行加以求证的结果，或者可以了解它的奥妙于万一。」（南怀瑾：《道家、密宗与东方神秘学》[台北：老古文化，1994]，页 32-33）
在密教里存有持诵咒语、观想种子字或本尊，身口意三密相应的修持法门。究竟这些特定的文字图案是否真有效应？早已引起科学人士的兴趣。日本江本胜博士，在研究水结晶状态的实验中亦发现：正向的意念、文字、声音、图案，尤其佛教的咒语圣号、梵呗等，都会产生结构完整而美丽的水结晶。详细内容可参阅江本胜博士《来自水的信息》一书（廖哲夫译）。
见如长老在《佛母大孔雀明王经导读》提到：近年有佛光大学「生命学研究所」硕士班研究生，特以「孔雀明王咒对降低手机电磁波之探讨」为主题，亲自到工业研究院作了实验， 证明贴上孔雀明王咒贴纸，或是自写孔雀明王咒语在手机上，确有明显降低电磁波的实际功效。这个实验结果证明了经中所云：「佛母大孔雀明王力，能除一 切诸毒。所谓『电毒』云毒，蛇毒龙毒，蛊毒魅毒… …悉除诸毒，获得安隐。」上述只是以手机为例，实验中，将咒语贴在所有产生电磁波的电器产品上，皆有降低电磁波的真实效应，证明佛言不虚。
古代的大德以持诵咒语所产生的振动力量，来净化人体内的水分，使身心内部产生根本的改变。持诵咒语对人的身体健康，心灵层面都有好处，因为持诵时所产生的音频振动力量，可以清净人体的细胞、气脉、明点，行者的心也自然会净化。咒语的威德力随着持诵者的心量、修行证量等，而有不同的理解，终致发挥出或深或浅或宽或广的能量与效验。
王翠玲教授在台湾中正大学中文学术年刊 2011 年第二期之《永明延寿的修行析论： 以有关朝暮二课的陀罗尼为主》提到：
「由显教的角度来看：中国诸多宗派的祖师大德们，如天台宗僧、华严宗僧等也对陀罗尼、真言、咒语不陌生，多有讨论，甚至也有具体持咒的情形，这同时也代表密教及密咒在历经翻译、流通、修持的过程之后，中国的僧俗二众已经逐渐将个人的修行、国家社会的需要与相互揉合，使自利与利他可以兼顾………….在整理、爬梳相关文献的过程中，对于延寿禅师具体持诵陀罗尼、真言、密咒之举动， 我们逐渐明白的是：关于密教在中国的发展、容受问题：若据目前所知而言，密教的法脉传承与真言、陀罗尼、咒语的流传，在汉传佛教中是被区分对待，而后者则持续活跃在中国佛教徒的信仰生活中，这在明代《诸经日诵集要》成书后更是大势底定，成为寺院朝暮二课的主要依据。」
家师观成上人曾有开示：
「人类的声音，若其节奏、频率能引发病者内心的共鸣，如宗教的念佛、诵经、念咒，可以促进疾病的痊愈。音声疗法是一种深层次的能量治疗，已经成为振动医学领域之一。振动可以降低心率变异性，放松脑波模式和降低呼吸频率。
适当的人音类声，如诵经念咒能：
–帮助减压放松
–消除内心的焦虑
–增加自信心
–克服内心的恐惧
–改善情绪病
–平和内心的暴躁
–舒展心怀
–内心得到平静」
佛教强调行者一定要靠发菩提心、止恶行善、持戒、精进持久修行，才能得到佛菩萨真正的庇佑。但是当一个人饱受病痛折磨，或处于精神不安的状态时，通过虔诚诵念经咒，也能为病人及照顾者带来安抚之效，并生起正念信心。如行持得当，就能消弭内在的无明恐惧和莫名忧虑，从而产生积极的正面情绪，如平静、喜悦和安住之心，消除种种的修行障碍，从而在佛法中得到更大的利益。
